Päätöksenteko ja vaalit
Ammattiliitto Prota johtaa satajäseninen edustajisto ja sen valitsema hallitus. Edustajiston valitsevat vaaleilla liiton jäsenet.
Pron puheenjohtajana toimii Antti Rinne. Hallituksen varapuheenjohtajina toimivat Riitta Suonpää ja Juha Kivistö. Edustajiston puheenjohtaja on Jukka Nyberg.
Hallinnon tehtävät ja vastuut on määritelty liiton säännöissä.
Pron hallituksen ja edustajiston jäsenten puhelinnumerot ja sähköpostit löydät Yhteystiedoista.
Ylimenokauden hallinto
Pron perustamista joulukuussa 2010 seuraavan kahden vuoden ajan (2011–2012) liittoa johtaa ylimenokauden hallinto.
Edustajistona toimii Ammattiliitto Suoran ja Toimihenkilöunionin (TU) nimeämistä henkilöistä muodostettu edustajisto.
Pron nykyisen hallituksen ja puheenjohtajan toimikausi on kaksivuotinen ja päättyy vuoden 2012 lopussa.